作者:马丽,白燕,刘仲明,刘芳
近几年来DNA电化学传感器在临床检测中的应用受到了广泛关注。Wang等用阳极氧化法,将与结核杆菌基因DR区相对应的两个长度分别为27bp和36bp的DNA探针,固定在碳糊电极表面,制成DNA电化学传感器,利用计时电位分析法,以33+Co(Phen)作指示剂,进行了DNA传感器用于结合杆菌诊断的初探。Hashimoro等将一个20聚体的核苷酸一端修饰上—SH,再通过—SH在金表面进行探针修饰,检测了PVM623的PartⅠ片断上的致癌基因V_myc。我们利用巯基与基底材料的强烈化学结合和聚亚甲基链的定向排列],采取自组装硫醇单分子膜技术研究了DNA电化学传感器的制备方法。并考察了DNA电化学传感器对血清样品中乙肝病毒(HBV)DNA的响应,通过与荧光聚合酶链反应(PCR)法的比较,初步探索了将该法应用于临床检测的可行性。
1实验部分
1.1材料与仪器
1.1.1试剂
Piranha溶液:98%(φ)浓硫酸-30%(φ)双氧水(体积比3∶1);DNA固定液:10mmol/LTris(NH2C(CH2OH)3)-HCl-1mmol/LEDTA溶液,称取Tris碱0.1211g,EDTA0.03722g,溶于90mL双蒸水中,用0.1mol/LHCl调节pH至8.0,然后定容至100mL(TE缓冲液);DNA杂交液:0.3mol/LNaCl-0.03mol/L柠檬酸三钠Na3C6H5O•2H2O缓冲液,pH8.0(2_SSC缓冲液);杂交指示剂:Hoechst33258(C25H24N6O•3HCl);杂交指示剂测试底液:0.1mol/L磷酸缓冲液,pH7.4;电极淋洗液:10mmol/LTris-HCl-0.1mol/LNaCl溶液,称取Tris碱0.9692g,EDTA3.8760g,溶于750mL双蒸水中,用0.1mol/LHCl调节pH至8.0,然后定容至800mL;其它试剂均为分析纯;实验用水均为二次蒸馏水;DNA提取液1、DNA提取液2,由深圳市匹基生物工程有限公司提供。
1.1. 2单链DNA(ssDNA)及血液样品
5'_HS(CH2)6—GGGTATACATTTGAACCCCAAT_3'单链DNA,由上海生工生物工程技术公司合成,其中HS(CH2)6为巯己基标记。10份血液样品由广州军区总医院检验科提供,其中3份经过荧光PCR标记法检测证明为不含乙肝病毒的正常人血液样品(即样品拷贝数小于40)。
1.1. 3仪器
CHI802电化学分析仪(上海辰华仪器公司);高纯氮;DL_60型超声波清洗器;金圆盘电极,内径5mm(上海辰华仪器公司)。实验采用三电极体系,Ag/AgCl电极为参比电极,铂电极为对电极,金圆盘电极为工作电极。
1.2单链DNA修饰金电极的制备
1.2.1电极的预处理
金电极经Piranha溶液、丙酮、无水乙醇依次浸泡0.5min,然后用0.05μmAl2O3磨垫抛光,超声波清洗约1min,氮气干燥。
1.2. 2单链DNA在金电极表面的自组装
将金电极浸入含有100mg/LHS—ssDNA(S0)的TE缓冲液中,于4℃放置12h,得到单链DNA修饰电极(HS—ssDNA_Au电极)。依次用10mmol/LTris-HCl-0.1mol/LNaCl溶液(pH8.0)、二次蒸馏水淋洗电极表面以去除未组装的DNA。
1.3. 3指示剂与单链DNA修饰金电极的结合
将HS—ssDNA_Au电极浸入含有100μmol/LHoechst33258的10mmol/LTris-HCl-0.1mol/LNaCl溶液(pH8.0)中,暗处放置5min。电极取出后,用10mmol/LTris-HCl-0.1mol/LNaCl溶液(pH8.0)、二次蒸馏水反复淋洗电极表面以去除由于静电作用而吸附在电极表面的杂交指示剂。
1.3双链DNA修饰金电极的制备
1.3.1血清样品预处理
取待测血清100μL加入到0.5mL离心管中,加入100μLDNA提取液1,振荡混匀,13000r/min离心10min,吸弃上清液;再加入25μLDNA提取液2,振荡10s(沉淀无需打散混匀),2000r/min离心10s,在100℃沸水浴放置10min,13000r/min离心10min,保留上清液用于双链DNA修饰电极的制备。如果本裂解产物当天不使用,则要保存在-20℃,使用前室温解冻,12000r/min离心5min。
1.3.2DNA的杂交反应
取上述制备好的血清样品20μL置于杂交容器中,用2_SSC缓冲液稀释至100μL,在水浴中99℃变性处理5min。变性完成后,立即转入0℃冰水浴中以防止DNA恢复双螺旋结构,并将按前述方法制备好的HS—ssDNA_Au修饰电极浸入变性后的血样中,室温下杂交90min,得到互补双链DNA修饰金电极(dsDNA_Au电极)。然后依次用10mmol/LTris-HCl-0.1mol/LNaCl溶液(pH8.0)、二次蒸馏水淋洗电极表面。1.3.3指示剂在双链DNA修饰金电极上的嵌入将dsDNA_Au电极浸入含有100μmol/LHoechst33258的10mmol/LTris-HCl-0.1mol/LNaCl溶液(pH8.0)中,暗处放置5min。电极取出后,用10mmolTris-HCl-0.1mol/LNaCl溶液(pH8.0)、二次蒸馏水反复淋洗电极表面以去除由于静电作用而吸附在电极表面的杂交指示剂。
1. 4电化学检测
采用线性伏安扫描法,以0.1mol/L磷酸缓冲液(pH7.4)为底液,扫描速度为100mV/s,在0.1~0.7V的电位范围内,分别测量指示剂在HS—ssDNA_Au电极和dsDNA_Au电极上的伏安信号。
2结果与讨论
2. 1指示剂在HS—ssDNA_Au及dsDNA_Au电极上的伏安信号
Hoechst33258作为一种电活性染料,在金电极上可以在较低的电位下(0.55V左右)产生一个不可逆的氧化峰电流,且电流密度较高(100μmol/L时可达到1.4mA/cm2)。对于裸电极,指示剂由于物理吸附而产生微弱的信号;对于单链DNA修饰电极,指示剂与ssDNA之间的化学结合作用使其产生氧化峰信号;对于双链DNA,指示剂可以嵌入到双链DNA形成的双螺旋结构的碱基对中,在电极表面形成dsDNA-Hoechst层,从而产生较强的氧化峰信号。对上述几种情况,指示剂的氧化峰电流响应值大小如图1所示。
3. 2传感器的特异性与重复性
将制备好的HS—ssDNA_Au电极分别与1mg/L、10μg/L两种质量浓度的互补DNA溶液和单碱基错配的DNA溶液作用。结果表明,当单碱基错配DNA溶液质量浓度(1mg/L)为互补DNA质量浓度(10μg/L)的100倍时,所得到的指示剂响应信号(0.026μA)大约为互补DNA溶液信号(0.052μA)的50%。故在一定质量浓度范围内,电化学DNA传感器能够较好地区分互补DNA序列和单碱基错配的DNA序列。用制得的10支电化学DNA传感器对拷贝(copies)数为4.98×106的血清样品进行10次检验,所得结果如表1。由表1可以看出,在对血清样品的检验中,电化学DNA传感器有着良好的重复性。
2. 3传感器的线性范围与检出限
实验证明,在0.05~1mg/L范围内时,不同质量浓度(y)的互补DNA与修饰电极杂交前后指示剂峰电流响应值之差(ΔIp/μA)呈线性关系。其线性回归方程为y=1.1389ΔIp+0.1791(r2=0.9955)。互补链质量浓度低于10μg/L时,虽然能够观察到指示剂在HS—ssDNA_Au和dsDNA_Au电极上的伏安信号,但如果有单碱基错配DNA存在,可能会造成较大误差。当互补链质量浓度在1μg/L时,指示剂在HS—ssDNA_Au和dsDNA_Au电极上的ΔIp接近于3倍的标准偏差0.051μA,该质量浓度视为检出限。
3. 4电化学DNA传感器法与荧光PCR法对血清样品检测结果对比
电化学DNA传感器法与荧光PCR法对血清样品检测结果对比见表2。对于PCR阳性者,DNA电化学传感器均能检出,且荧光PCR分析结果中拷贝数越高的,在传感器分析结果中其ΔIp值越大。而对于正常人的血样,用传感器法观察到指示剂的电流响应比阳性样品小得多,低于检出限信号(ΔIp<0.051μA)。由此说明,DNA电化学传感器可以检出血清中的乙肝病毒。从本实验可以看出,DNA电化学传感器法具有较好的特异性、重复性,且不需PCR扩增,避免了由于PCR扩增污染而导致的假阳性结果。同时有利于进行集成化,实现多基因同步检测的目的。因此,电化学DNA传感器应用前景广阔,具有临床推广价值。
来源:中国电化学网